
“构建数字生理人”“为40万亿个细胞写‘家谱’”“解码生命之书的未来‘密钥’”……近日,国家“十四五”重大科技基础设施、广州“2+2+N”科创平台体系的重要一极——人类细胞谱系大科学研究设施(以下简称“细胞谱系设施”)正式启动建设,那么,接下来“数字生理人”如何构建?为细胞写“家谱”有什么用处?他们又将如何赋能生命科学和相关产业发展,成为护佑人民生命健康的国之“盾牌”?
带着这些疑问,记者来到已先期建成的细胞谱系设施研发楼,采访了设施牵头建设单位中国科学院广州生物医药与健康研究院(以下简称“广州健康院”)的专家,了解这一国之重器的运行之道。
数字生理人有什么用?
模拟生老病死 抢占生命科学制高点
人体由约40万亿个细胞组成。最初,每个人都来自一颗受精卵细胞,随后不断分裂、增殖、分化,演变成不同的器官组织:肾、骨头、心脏等。细胞会生长,也会衰老、病变、死亡……而细胞谱系设施的核心工作就是为40万亿个细胞绘制“家谱”,解析细胞的生长、衰老与死亡程序,最终构建“数字化生命”,打造生命科学领域的超级大模型——“数字生理人”。
“构建这个细胞谱系大模型,将催生生物医药研究的新范式,对未来新药开发、疾病诊断、衰老预测具有重要作用。”广州健康院副院长(主持工作)、细胞谱系设施总指挥孙飞研究员告诉记者,未来,利用“数字生理人”大模型,医生可以在数字空间里进行精准的疾病诊断,新药研发者可以进行精准的新药物靶点开发。

生命科学和人工智能领域的交叉融合,在国际上已有成功范式。中国科学院广州生物医药与健康研究院二级研究员、细胞谱系设施副总指挥陈捷凯告诉记者,可预测蛋白质结构的人工智能系统AlphaFold去年就获得了诺贝尔化学奖,为生命科学研究领域带来了颠覆性进展。“因此,建设细胞谱系设施、打造‘数字生理人’大模型,正是我们抢占生命科学战略制高点的关键举措。”
陈捷凯透露,尽管细胞谱系设施还需要4年半时间建成,但依据目前的数据和模型算法的开发进度,未来一两年,“数字生理人”的基础版本——“数字细胞”就将面世。“随着设施的建成和数据的完善,数字生理人就会升级到2.0版、3.0版。而随着版本的跃升,模型性能也会大幅度提升。”陈捷凯表示,细胞谱系设施将通过生命最基础的细胞来模拟生命过程。
数字生理人“出厂记”
从ChatGPT到DeepSeek,过去两年来,公众对于大模型已经不再陌生,但因为模型被投喂的数据质量不高,大模型出现“灌醉”、“幻觉”、胡言乱语等情况比比皆是。
为了防止出现这样的状况,细胞谱系设施对“数字生理人”模型采集数据的质量要求非常高。据陈捷凯介绍,一直以来,在不同的生物实验室,实验主要由科研人员手动操作,其数据会存在一定偏差,这种偏差将让AI模型训练的性能下降。为此,细胞谱系设施早在立项之初,就要求所有的样品信息采集关键步骤都采用标准化无人操作,比如,每一个细胞样品从细胞消化到核酸提取的时间都是完全一致的。这些标准化程度非常高的数据保证了“数字生理人”模型的优越性能。
●获得组织器官:从医院获取符合伦理规范的组织器官,经初步检查处理后,通过灌流保持组织活性,转运至人类细胞谱系大科学研究设施。

获得组织器官
●获得内部结构信息:在保持细胞活性的前提下,通过材料填充,为样本提供物理支撑。进而CT成像,获取器官内部结构信息。

获得内部结构信息
●切块、成像、组学测定:样品进入切块程序,经过多次切割后,获得统一尺寸的标准组织块。组织块经OCT成像、喷码标记后,自动转运至切片流程。可以精确追踪每一个切片的空间结构来源。一些关键部分将采样进行超微结构成像,获取超微结构组数据。获得单细胞悬液后,通过微流控技术,精准捕获单个细胞,用于单细胞分辨率的组学测定。剩余的单细胞、标准组织块等,转运到细胞谱系资源库存储。
●获取多组学融合数据:标准组织块经低温自动切割成像后,用于空间组学分析。通过微流控等技术,对冰冻组织切片进行空间位置标记,获取具备空间位置信息的多组学融合数据。设施也将直接在冰冻组织切片上,获得具有亚细胞分辨率的基因表达、基因突变和空间位置信息。

获取多组学融合数据
●绘制数字生理人:收集完一系列信息后,依托人工智能和云计算,形成细胞谱系大模型,实现细胞谱系的数字孪生。验证后,最终获得人体发育谱系、疾病谱系和衰老谱系。在此基础上,绘制出数字器官和数字生理人。

绘制数字生理人
研发矩阵
仪器设备自动化、智能化、标准化
在细胞谱系设施研发楼,记者见到了科研人员研发的大量自动化、智能化、标准化仪器设备。

标记切片组织:自动化空间多组学微流控系统
“这是我们研发的自动化空间多组学微流控系统。”细胞谱系设施研发楼内的一位科研人员告诉记者,他们设计了两种微流控芯片,可以自动化对切片组织进行空间标记,为这些组织标上“坐标轴”,并自动标记生成包含不同信息的条形码。“自动化、均一化、标准化的操作流程,使效率得到极大提高。”
机械臂培养细胞:全自动细胞培养系统
研发楼内,记者见到一款具有全部自主知识产权的全自动细胞培养系统。该系统上下4层,每层6个小盒子,每个小盒子就是一个细胞培养箱,相较其他实验室培养细胞主要依靠人工操作,该系统侧面自带的机械臂,将提供标准化、自动化的操控。
自动化标准化检测:我国首台透射电镜TH-F120
研发楼内还出现了由广州生物岛实验室领衔研制,广州慧炬科技有限公司负责生产的我国首台透射电镜TH-F120的身影。科研人员介绍,他们正对TH-F120进行改造,使之能够实现对样品自动化、标准化的检测。
研发楼内,记者还见到了设施参建单位广州实验室自主研发的小型科研设备,包括高通量成像流式细胞仪、主动式单细胞测序仪、被动式单细胞测序仪,这些设备大部分是基于微流控技术的。
“沿途下蛋”
建设过程带动国产先进仪器试剂发展
值得一提的是,细胞谱系设施在建设“数字生理人”模型的过程中,也将大大提升我国科学仪器技术和产业的发展。
“在细胞谱系设施建设过程中,我们秉持了‘沿途下蛋’的理念,设施涉及的仪器设备中,85%以上都通过我们自主研制来完成。这些自主研制的科学仪器,在设施建设期间就可以进行相应的成果转化,推动我国科学仪器产业的进步。”孙飞提到,整个设施的建设过程将带来四项科技成果和产品,科学仪器是其中一项,第二项是先进的生物学试剂,第三项是人工智能和生物医学数据相结合的算法,第四项就是大规模、高标准的生物医学数据,“我们会在仪器、试剂、软件,还有数据方面,实现‘沿途下蛋’,推动粤港澳大湾区乃至全球的生物医药和健康产业发展。”
重构范式
观察生命—模拟生命—设计和改造生命
广州健康院相关人士介绍,基于海量的数据,科学家将构建“数字生理人”,不仅能模拟生命发育过程,还能“生病”“试药”和预测疾病发展,最终将重构生物医学研究范式。生命科学将完成“观察生命—模拟生命—设计和改造生命”的范式转换。
药物开发从盲筛走向推演
传统药物研发像“死亡之谷”,成功率只有10%。大设施则可通过回溯疾病细胞的谱系演化,定位驱动病变的关键靶点,发起“斩首行动”式精准打击。还可以让“数字患者”替你“试毒”“试药”,使药物研发周期从十年缩短到两三年,成本降低70%。
医疗决策从通用走向定制
在大设施支撑下,医疗决策可实现从群体统计学到个体系统生物学的范式跃迁。用患者特异性的基因信息构建一个“数字你”,模拟不同药物在“数字你”体内的作用路径,实现治疗手段的“量体裁衣”。
疾病从治疗走向预防
通过细胞谱系数据推演细胞命运,进而预演疾病发生轨迹,使我们拥有了在疾病发生前按下“暂停键”的能力。这将医疗干预的起点从病症爆发点前移至细胞编码程序失调的源头,推动医学范式从被动治疗向主动预防的跃迁。
●科学家解前沿
中国科学院广州生物医药与健康研究院二级研究员、细胞谱系设施副总指挥陈捷凯:
数字“分身”先试药真人临床少“踩雷”
陈捷凯告诉记者,细胞谱系设施建成后,将对生命健康产业的发展产生众多影响。
一是让科学家对疾病的了解更加深入。例如,现在科学家对肿瘤的形成机制仍然有很多疑问:为何一个致肿瘤的基因会导致细胞出现癌化,最终导致人患上癌症?这个作用机制中,有哪些地方是医学可以干预的?因为生命是由细胞组成的,通过细胞谱系设施,我们就可以解析这个过程,而“数字生理人”可以帮助科学家在计算机上模拟生命的生理活动,同时也可以模拟疾病过程。
通过对这一过程的推演,科学家有望找到干预靶点,从而发现新的靶向药物。陈捷凯说:“‘数字生理人’通过病源虚拟干预,可以生‘数字病’,我们就可以喂他吃‘数字药’,看哪种药最后能起效。这样能大幅度带动生物医药产业发展,实现‘换道超车’——通过细胞谱系设施,我们将从传统的生物医药研发赛道转换到数字化的赛道,这也是近年来科技发展主要的趋势。”
陈捷凯说:“目前,全球生物医药产业中,寻找先导化合物,进行新药研发是非常普遍的创新药模式,但发现先导化合物也有两种方式,一种是靶点依赖型,另一种是表型依赖型。其实,当下很多成功的新药仍是基于表型依赖型方法而发现的,速度较慢,有了‘数字生理人’后,就可以把原先需要在真实的生命现象中测试的过程,放到数字筛选上,这就会大幅度加快新药研发的进程。”
陈捷凯表示:“新药在进行一、二期临床时,失败率是非常高的,究其原因,主要是我们的药物在人体测试之前,不知道它的毒性和效果。科学家之前只能用小鼠、猪等动物做实验,得不到药物进入人体的真实反应。通过‘数字生理人’,我们将有可能预测这些新药在人体中会有什么反应,大幅度减少终将失败的药物进入临床试验的概率。”

统筹/梁倩薇、嵇沈玲
文/广州日报新花城记者:武威
图/广州日报新花城记者:王维宣 通讯员胡冰鑫
广州日报新花城编辑:马俊贤
相关文章:
科技周刊丨数字生理人,替你生病帮你试药04-16
辟谣!“成立数字人民币银行、招募数字人民币推广员”系谣言04-12
一场盛会共赴“未来之旅”,交流对接促广东文旅供需双赢04-12